水庫工程地質條件復雜，巖層產狀變化大，節約裂縫發育，巖體完整性差，水庫周圍山體薄，地下水和相對不透水層頂板深埋(遠低于水庫正常蓄水位)，水庫集雨面積小，天然供水量少，水庫防滲問題突出，需要進行全水庫防滲。經過多種防滲方案的比較論證，最終選擇了采用水庫和水庫岸鋼筋混凝土面板、水庫底土工膜的全水庫組合防滲方案。

上水庫底部采用高挖低填，防滲面積25萬m2，其中開挖區占1/3左右，回填區占2/3左右。由于石渣回填區厚度變化大(厚度3~75m)，導致沉降變形不均勻，要求防滲材料具有較強的適應不均勻變形的能力。設計從解決本工程水庫大量廢渣堆積問題，減少上水庫死亡容量，縮短水庫初始蓄水時間，降低工程運行維護成本和維護難度，降低施工難度，加快施工進度，節約工程投資等多方面考慮，對庫底防滲材料進行多方案研究比較，選擇庫底防滲材料采用土工膜。

為了解決膜下排水問題，工程選擇了近年來新興的土工排水材料，并與傳統的碎石排水層進行了比較，大膽嘗試采用新材料、新工藝，為節約工程投資，加快施工進度，積累土工排水網的設計和施工經驗提供了有益的探索。