復合土工膜屬化學類物質，有機材料，被動防水，易老化，使用壽命有限；膨潤土防水毯是天然的無機材料，抗滲體為鈉基膨潤土，主動防水，不會老化，也不會因干濕和凍融反復循環而降低防滲效果，具有永久防水性能，使用壽命長。不能與二襯合為一體，易竄水；膨潤土防水毯透水性極低，能與二襯合為一體，不易竄水。
復合土工膜遇基層異物、水壓不勻易造成破漏，致防滲失敗；膨潤土防水毯屬柔性材料，能較好地適應不均勻沉降，可以適應復雜的施工現場。發生破損，修復難度大；膨潤土防滲毯具有獨特的自我修復功能，即使銳利異物刺破膨潤土膨脹后形成的凝膠可迅速自行修復，防水安全保障性能優異。
膨潤土防水毯屬于環保型材料，施工時，不會產生任何污染，同時不會完全隔斷防滲體上下水體的聯系，可保持與周邊生態環境的交互融合，利于水生動植物、微生物生長繁殖，形成良好的生態環境，且植物可穿透防水毯自由生長，也不至于發生漏水，是一種改善生態環境的新型材料。

復合土工膜施工需要特殊焊接、黏結工具，而且工藝要求高，焊接質量檢測繁瑣，管線貫穿封口困難，對施工溫度有限制；膨潤土防水毯對鋪設場地及回填覆蓋土的要求比較低，對施工溫度沒有要求，一般的基底經壓實后就可滿足鋪設要求，自然搭接，節點處理便捷可靠，尤其在管道、貫通及建筑物周邊等特殊界面的結合部位，施工更便利，接縫處的密封性更有保障，質量檢測方便，鋪設簡便而且成本低，有效縮短施工周期。經過充分比較、論證后，確定選用鈉基膨潤土防水毯作為河道綜合治理工程底部防滲鋪設材料。